某天放學，蔡小豆回家發現自己家來了一個人，叫藍多多，是比特星人，要找到落在地球上的源水晶，爲了騙過小豆父母讓藍多多暫留在小豆家裡，就說藍多多是小豆遠房小姨的兒子，因爸媽到外國工作，要借住在自己家一段時間，蔡小豆平白無故多了個表哥。
藍多多告訴小豆，自己所在星球被暗黑星球的人污染了環境，他被派到地球來尋找金、木、水、火、土來拯救自己的星球，他的探測儀發現目標就在蔡小豆家附近，所以暫時在蔡小豆家潛伏下來，伺機尋找。藍多多將飛船藏到了蔡小豆的牀下，蔡小豆、古拉、古麗、包子幫藍多多找來了金、木、水、火、土五種元素，卻發現無法發揮作用，他們意識到藍多多的任務沒那麼簡單。
藍多多在飛船上探測到的物品叫源水晶，被藏在黑心博士的實驗室中，黑心博士因早年做實驗被核輻射污染，身患重病，不得已跟黑星球的人做了一筆交易，黑星人給了黑心博士源水晶，被隱藏在一個阻隔所有探測信號的盒子中，黑心博士按時要用源水晶製作藥水給自己治病，代價是要作爲黑星球的傀儡，不停地破壞地球。
蔡小豆在學校遇到困難，回家向藍多多訴苦，卻發現藍多多擁有超能力，可以幫他解決問題，蔡小豆藉助藍多多的超能力工具解決了問題，卻引來了更多麻煩。古麗、古拉、包子、關小穎四個小夥伴很快得知了藍多多的外星人身份，卻商定好爲藍多多保密。
藍多多通過探測儀搜索，將自己要尋找的神秘元素的範圍不斷縮小，發現就在學校裡，幾個小夥伴開始幫藍多多一起尋找，藍多多也藉助記憶消除棒的幫助，跟大家一起到學校上學，伺機尋找，同時也認識了剛猛的費老師，彎彎繞的胡老師與和藹可親的高校長。
黑心博士破壞地球的計劃受到阻撓，經過調查發現是藍多多的作用，黑心博士想要消滅藍多多，兩人互相鬥法，卻總是不分伯仲，黑心博士爲了讓自己計劃順利實施，開始想辦法抓藍多多，但是卻總是失敗。
在藍多多終於找齊了五種元素之後，小朋友們也都知道了包子的爸爸就是黑心博士，同時，也知道了包子的媽媽就是黑星將軍，藍多多成功喚醒了源水晶的能量，打敗了黑星人，並治好了包子和他爸爸的病。
多多打敗黑星人，該回比特星了。總是有萬般不捨，他還是踏入了飛船。這時，智慧女神出現了，她讓多多看看夥伴們給他的U盤。原來，裡面都是大家對多多的美好祝福。多多看完後，終於明白大家多麼捨不得他，大家對他的感情有多深。可如果他選擇留在地球，法力將會消失，星際精靈的稱號也會被剝奪，並且作業不好會被老師批評，被家長批評……在法力和友情之間，多多選擇了友情，留在了地球，當一個普普通通的地球孩子。“大新聞！大新聞！今天會有一百年出現一次的流星雨，我們這裡還是最好的觀看區呢！在平地裡都能看見！”包子一大早就興奮地喊。“真的？”古麗不相信地問。“當然是真的！你看新聞就知道了！”包子自信地說，也不知道他哪裡來的自信。知道劇情的夢水伊心想。“我們一起去看流星雨吧！”古拉提議道。“我帶相機！”關小穎說。（關小穎：我的天哪，你總算讓我出場了。星願：人家星際精靈藍多多劇組讓你出場少你毫無怨言，我讓你出場少你就抱怨東抱怨西，小官迷！關小穎：。。。。。。）“我帶望遠鏡！”古麗興奮地說。“唉——”一旁的小豆唉聲嘆氣，齊格飛問：“小豆，你怎麼唉聲嘆氣的？”（齊格飛：作者大人，你總算讓我出場了。星願：不好意思，人太多，一不小心54你了。關小穎：你可不是這麼對我說話的！星願：小官迷，你尊重我，我也會尊重你。關小穎：。。。。。。）“唉，我媽晚上不讓我出門。”蔡小豆唉聲嘆氣地說。“你不去算了。”古拉自動把蔡小豆當隱形人，拉着古麗、包子說。晚上，“多多，你幫幫我吧，我好想去看流星雨！”蔡小豆又開始了以前的請求模式。“第一，我現在沒有法力了，怎麼幫你？第二，姨媽也不准我們晚上出去，你想被姨媽罵？所以，只有一個辦法，那就是，不要去看流星雨！”藍多多看着書，說。“不嘛不嘛，一百年一次也，你就幫幫我吧。”蔡小豆開始了耍賴模式。“這是怎麼了？”布萊克問。“我想去看流星雨，可是我媽她不讓我去！”蔡小豆說。“姨媽不讓就不讓唄，反正我們也打不過她。”布萊克說。“有沒有什麼辦法，能夠讓我出去不被發現？”蔡小豆問。“瞬移水晶。”布萊克冷漠地說。“瞬移水晶？那是什麼？”藍多多和蔡小豆異口同聲地問，默契度達100%啊！“還是蓋亞送雷伊的。”布萊克說。另一邊，古麗家，“姥姥，白願在家嗎？”雷伊問古姥姥。“她和朋友出去了，怎麼，又來找白願玩啦？”古姥姥說。“她現在在哪？”雷伊問。“在學校圖書館。”古姥姥笑着答。雷伊心想：學校圖書館？那裡已經關門了，白願去那裡幹什麼？學校圖書館，“可惡，怎麼都沒有？”白願心浮氣躁地說。“再找找看吧。”關鍵時刻，夢水伊冷靜極了，是她的深藍色眼睛起作用了。“我們都翻遍了整個圖書館，一點線索都沒有，怎麼找啊？”星緣也受不了了，說。正說着，“誰在那啊？”聲音很耳熟，好像是藍多多、蔡小豆表嬸的聲音。夢水伊心想。“時光凍結！”夢水伊一個技能打過去，時間凍結了，“快跑！”夢水伊喊道，率先逃跑，其他人也跟着跑了。蔡小豆家，雷伊心想：白願也不在圖書館，她現在在哪裡？“雷伊，蔡小豆想找你借瞬移水晶！”布萊克的聲音打斷了雷伊的思路。“給！”雷伊直接把水晶扔給他，什麼也不問，把布萊克嚇壞了。藍多多用水晶製造了一個能瞬間移動的機器，不過只能用一次。蔡小豆用機器瞬移到了花園，才知道包子看錯了，流星雨是在明天。機器又不能用，蔡小豆只好請求朋友們掩護他回家，卻被朋友們整了一頓，告訴爸爸戀愛大法，卻錯失了良機，是他爸爸被黑心博士罵